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Teaching

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A-Modul Bioinformatik


Zielgruppe: Studierende der Biolgie (BSc und MSc)
Zeit: jeweils im Sommersemester, Donnerstags ganztägig

Das A-Modul Bioinformatik vermittelt den praktischen Umgang mit Standard-Werkzeugen der Bioinformatik, insbesondere im Umgang mit Sequenz-Daten. Thematisch werden die Themen der Homologie-Suche, der Genom-Sequenzierung, der Vorhersage und dem Vergleich von RNA-Sekundärstrukturen sowie die Rekonstruktion von phylogenetischen Bäumen behandelt. Einen weiteren Schwerpunkt bildet der Umgang mit Next-Generation-Sequencing Daten, um etwa Gen-Regulation auf der Ebene des Transkriptoms oder Mutationen auf der Ebene der DNA zu untersuchen. In diesem Rahmen werden auch Programmierkenntnisse, insbesondere in der Programmiersprache Perl, vermittelt.

Weitere Informationen finden sie in Moodle:

Moodle: Ruhr-Universität Bochum

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A-Modul Biophysik II


Zielgruppe: Studierende der Biolgie (Optionalbereich, BSc und MSc) und Medizinischen Physik (MSc).
Zeit: Blockveranstaltung im Sommersemester zum Semesterende

Das A-Modul II vermittelt eine forschungsnahe Einführung in den Umgang mit Techniken der Spektroskopie und Mikroskopie. Dabei werden einerseits mit Hilfe der Infrarot-Spektroskopie Strukturbiologische Fragestellungen bearbeitet, andererseits werden mit Hilfe der spektralmikroskopischen Bildverarbeitung Techniken erlernt, die bei markerfreien bildbasierten Biomarker-Studien zum Einsatz kommen. In diesem Rahmen werden auch entsprechende Kenntnisse der Bioinformatik, insbesondere der Verarbeitung mikroskopischer Daten in Matlab, vermittelt.

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Vorlesung Methoden der Bioinformatik

 

Zielgruppe: Studierende aller Fächer, insbesondere Studierende der Biolgie (Optionalbereich, BSc und MSc) und Medizinischen Physik (MSc).

Das Fundament der Bioinformatik bilden grundlegende Konzepte aus der Mathematik, Informatik und Statistik. Diese werden in dieser Vorlesung anschaulich und für ein breites Publikum verständlich eingeführt. Die Vorlesung ist auch in Form einer Video-Aufzeichnung verfügbar und folgt damit einem "Flipped Classroom" Konzept, welches in Präsenz-Veranstaltungen ein hohes Maß an Interkation zwischen Lehrenden und Studierenden ermöglicht.

Weitere Informationen finden sie in Moodle:

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Vorlesung Bioinformatics for Biochemists

Zielgruppe: Studierende der Biochemie (Pflichtveranstaltung im 7. Semester), Studierende der Biolgie (Optionalbereich, BSc und MSc), Angewandten Informatik (BSc Wahlpflichtbereich) und Medizinischen Physik (MSc).

Die Vorlesung erklärt grundlegende Ansätze des Sequenz-Vergleichs und der Analyse von genomischen und anderen Sequenzen aus einer anwendungsnahen Perspektive. Auch grundlegende Kenntnisee zu Proteinstrukturen und moelkulardynamischen Simulationen werden vermittelt.

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Vorlesung Bioinformatik (Biologie III)

Zielgruppe: Studierende der Biolgie (Pflichtveranstaltung im BSc 3. Semester).

In diesem Teil der Biologie III Vorlesung werden die elementaren Begriffe und Konzepte der Bioinformatik vermittelt.